这是游戏制作公司Key在Kanon之后的第二作,故事讲述一个跨越千年的故事。
一位懂“法术”的、以表演人偶为生的青年国崎往人,一天来到一个海边小镇,遇上了主角的神尾观铃而展开的故事。国崎往人和他的祖先们一直都在找一位在天空中飞行有翼的女孩子,而在和观铃一路相处之下,観铃可能就是他要寻找的女孩子。
在古日本有位背上长上一对翅膀的女孩子(称为翼人)翼人一直也是古日本的兵器,最后一个翼人神奈备命,被视为接近神的人一直被当作求神赐予粮食的工具,因为如此,令外界对她又爱又怕,视为不祥又视为神圣。后来遇上了被派来“保护”她的柳也,和女官里叶一起去寻找母亲(八百比丘尼)曾为兵器而受着死后士兵的咀咒。寻找到母亲后,不久母亲就被弓兵射死,神奈是在空中被弓兵乱箭射死和被降魔咒所伤。可是死后她没有掉下来,而是在空中飘浮着,并且受到诅咒,堕入无限的轮回,一直被困在悲伤的梦中。里叶和柳也为了帮助神奈,决定为了替神奈解咒,要诞下后代来替自己完成心愿。1000年后也就变成了翼人传说。
能承继翼人千年之梦的观铃就是继承翼人的女孩,往人(和其祖先)则是柳也他们的后代,而原作中出现的佳乃和美凪则是和从翼人的翼掉下来的羽毛所影响的人物。故事的重心是“家族爱”(亲情)。